近期花蓮瓜農二期西瓜種植在即，引發民眾質疑孳生蒼蠅係為瓜園未依規定深埋糞肥及廢瓜所致。花蓮縣環境保護局依據「瓜園使用鷄糞為肥料及廢瓜未依規定處理引致病媒孳生者為污染環境行為」之公告，聯合各機關單位(含土地所有機關)辦理聯合稽查作業，因防疫三級警戒期間，縣府加強於防堵疫情擴散作為，聯合稽查作業將延至解除三級後辦理，現階段先行由轄區鄉鎮市公所、區農會及土地所有機關辦理輔導相關農民事宜。
    近期有民眾於臉書社團反映「大家有沒有覺得蒼蠅變多了呢?」貼文一案，經臉友評論發生地點為光復鄉及萬榮轄區，亦有評論為「一定是有農友使用雞糞肥」等回應，花蓮縣壽豐鄉、鳳林鎮、玉里鎮、卓溪鄉等轄區西瓜園因瓜農使用雞糞肥作為肥料，其常見違規行為有：肥料袋於進場後未完全覆蓋、施作時未依規定確實掩埋於土中、種植期間疏果廢瓜與收成後剩餘廢瓜未依規深埋土中30公分或妥善清除處理，進而造成孳生蒼蠅影響環境衛生等問題。

    花蓮縣政府自民國92年3月21日發布「瓜園使用鷄糞為肥料及廢瓜未依規定處理引致病媒孳生者為污染環境行為」之公告後，花蓮縣環境保護局依據相關法令辦理宣導與裁罰至今已有顯著改善。縣府每年均有結合中央駐地機關及各區農會積極輔導相關瓜農，並確實宣導如何正確施作，以免違反規定，造成民眾生活品質之困擾，另租地農民於種植期間違反相關法令，土地所有機關亦有撤租等方式辦理。
    環保局再次呼籲，農民於西瓜園一期及二期整地、種植、採收期間，應按規定確實配合施作將糞肥及廢瓜深埋，避免裸露招致蒼蠅，縣府將於各施作時期召集第九河川局、國產署、臺東農場與花蓮分場、花蓮光復糖廠等租地機關(構)，以及本府農業處、衛生局、環保局、各轄區農會、各鄉鎮市公所加強辦理聯合稽查作業，強力取締瓜農違反相關法令之行為，以避免孳生蒼蠅引響環境衛生及民眾生活品質等問題，共同來維護我們縣轄清淨的生活環境。
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